El templo de Khonsupakherod al noreste del Templo Mut estaba originalmente fuera del Recinto Mut. Fue construido para una emanación secundaria de Khonsu durante la XVIII dinastía por Amenhotep III, renovado y ampliado por Ramsés II, que hizo del edificio un "templo de millones de años" dedicado a sí mismo y a Amón-Re. Añadió una explanada, un pilono, dos estatuas de granito colosales de sí mismo y dos estelas colosales de alabastro. La primera, registrando su matrimonio con una princesa hitita, fue descubierto por Maurice Pillet en los años veinte. La segunda fue descubierto por la Expedición Mut en 1979 y registra el trabajo de Ramsés en un templo, lo más probable es que sea el templo ante el cual estaba la estela.

Durante el reinado de Taharqa el Recinto Mut fue ampliado para incluir el Templo de Khonsupakherod. En la XXI Dinastía, este templo ya se había convertido en un mammisi, un templo que celebra el nacimiento divino de un dios (en este caso Khonsu, hijo de Amón y Mut) y del propio rey. Al parecer el templo de Ramsés III ya no estaba en uso, ya que el segundo pilono del Templo de Khonsupakherod parece haber sido construido en parte con la piedra extraída del templo de Ramsés III, incluyendo los pies, torsos y cabezas de estatuas colosales que una vez estuvieron en su patio. Como parte de la expansión del recinto y la rededicación del Templo de Khonsupakherod, Taharqa creó una vía procesional que conduce de una puerta en la pared occidental nuevamente construida del recinto a ese templo.