El gran templo de Amón de Napata (B 500) era el templo más grande construido en Nubia, con una longitud total de 156 m. Sin embargo, no alcanzó su tamaño final hasta el reinado del rey Kushita Piankhy (aproximadamente 747-716 a.C.), que completó la sala hipóstila (502) y añadió su patio exterior (501). Estas adiciones agrandaron por dos tercios el núcleo original del templo que había sido construido en, por lo menos, seis etapas por los faraones egipcios de las dinastías de mediados la XVIII a la XX (quizás incluso XXI) (1446-950 a.C.). Los restos mejor conservados son los de las estancias más internas. El resto más antiguo del templo es unos cimientos fracmentados de adobe llamados B500-sub, que fueron descubiertos debajo del pavimento de piedra de la dinastía XVIII en el patio B503 junto a B504c. Lo que queda de esta estructura se supone que es un fragmento del primer templo de Amón que fue ordenado por Tutmosis III (1479-1427 a.C.) poco después de la ocupación militar de Gebel Barkal, aproximadamente en 1446 a.C.

Los siguientes reyes contribuyeron a aumentar la construcción del templo: Tutmosis III, Amenhotep IV, Tutankhamón y Horemheb, Seti I y Ramsés II. La última adición egipcia conocida al templo pudo haber sido una pequeña capilla construida por el Sumo Sacerdote Tebano de Amón (más tarde "Rey") Menkheperre (aproximadamente 1045-992 a.C.) de la Dinastía XXI.